耕地占用税计入哪个科目核算，需要看拿地用途的。如果是房地产企业拿地用于房地产开发，那缴纳的耕地占用税计入开发成本科目核算。如果是工业企业拿地用来建造厂房，那缴纳的耕地占用税是计入在建工程科目核算，完工结转到固定资产。